Jusqu'à la mort d'Al-Hakam II, en 976, le califat de Cordoue est un état puissant et stable. Une guerre civile va déstabiliser le régime et finalement, provoquer son effondrement. Elle commence avec la mort d'Al-Mansûr (Almanzor, le victorieux) en 1002 et se termine par la constitution des taïfas, vers 1040.

A son avènement, Hicham II est encore enfant, et c'est le vizir Al-Mansûr qui prend durablement le pouvoir et le conserve, au pont de réussir à le transmettre à son fils, Abd-el-Malik. Après un gouvernement cahotique, Abd-el-Malik meurt en 1008, laissant le pouvoir à son frère Abd al-Rahman Sanjul : ce dernier persuade le calife Hicham II de le désigner comme héritier du califat.

Profitant de l'absence du nouvel homme fort, parti combattre le roi Alphonse V de León, l'omeyyade Muhammad II détrone son cousin se proclame calife (1009). Abd al-Rahman Sanjul tente de reprendre le pouvoir, mais il est capturé puis exécuté. Muhammad se rend rapidement impopulaire, et une opposition se forme autour d'un autre omeyyade, Sulayman : soutenu par les Berbères, celui-ci devient calife (1009).

Ces luttes incitent les Hammudites, une famille possédant Malaga et Algésiras, à marcher sur Cordoue, où ils détrônent Sulayman. Ils ne tardent pas à se déchirer entre eux, et perdent définitivement le pouvoir en 1023. L'Omeyyade Abd al-Rahman V devient alors calife (1023), mais pour remplir les caisses de l'état qui étaient vides, il recourt à l'impôt... et il est renversé par une autre révolution (1024).

Trois autres califes, deux omeyyades et un hammoudide se succédent jusqu'en 1031, date à laquelle la bourgeoisie de Cordoue chasse le dernier omeyyade et abolit le califat.